La Unidad Educativa mixta “Virgen del Cisne” se inició como jardín de infantes y escuela completa en el periodo lectivo 1993 – 1994, legalemente autorizado mediante resolución de la Dirección Provincial de Educación de El Oro, según resolución 2577 el 23 de Noviembre de 1993.

Sus primeros profesores fueron: Aurelio Blacio Tinoco, Angela Villamar, Esperanza Sanchez, Xiomara Correa (3er grado), Fátima Yánez (2do grado), Blanca Ocampo (1ero “A” ), Rocio Aguilar (1ero “B”), Geomar Guaycha (Preparatoria), Vicenta Meza (Cultura Física), Victoria Chávez (2do grado), Dra. Teresa Merino (laboratorio), Juana Tenecela (Área de Inglés). La preparatoria funcionaba en jornada diurna y vespertina.

El Octavo año de básica, inició sus labores en el año lectivo 2004 – 2005, contaba con 27 estudiantes y 8 profesores, y funcionó en jornada vespertina.

El año lectivo 2007 – 2008, inició sus labores el ciclo deiversificado contando con 17 estudiantes y 7 profesores en jornada vespertina.

El año lectivo 2008 -2009 inicia sus labores el 2do año de bachillerato con la especialidad en gestión administrativa y contable (bachilleres en contabilidad).

Para el periodo 2009 -2010 la unidad educativa contó con educación básica de primero a décimo año en la sección diurna, mientras que primero a tercero de bachillerato funcionó en la sección vepestirna.